Niektóre szczepy probiotyczne wytwarzają w jelitach neurotransmitery, m.in. serotoninę, melatoninę, kwas gamma-aminomasłowy (GABA), dopaminę czy histaminę. To właśnie od nich zależy nasze zachowanie, zdolność uczenia się i pamięć. Co więcej, dobre bakterie zwiększają plastyczność mózgu, a to oznacza zdolność do jego regeneracji.